韩君
北京康仁堂药业有限公司
摘要：目的：探讨TFRC对肝癌HepG2细胞转录组水平的影响，解读其潜在的功能。方法：根据癌症基因组图谱(TCGA)数据分析，发现TFRC与肝癌患者的预后密切相关，采用TFRC敲低的肝癌HepG2细胞和阴性对照肝癌HepG2细胞进行转录组RNA测序，筛选差异表达基因并进行GO注释分析，KEGG富集分析和蛋白互作网络分析。结果：两种HepG2细胞转录组中筛选出869个差异表达基因(DEGs),功能分析发现多个DEGs与血管和神经元调节有关；依据血管和神经元相关的DEGs,构建调控网络，发现TFRC是该网络的节点基因。结论：TFRC是血管和神经元调控的重要基因。
关键词：TFRC;RNA-seq;差异表达基因;血管调节;神经元调控;
DOI：10.19296/j.cnki.1008-2409.2022-05-004
PDF下载：点击下载
版权所有：华夏医学(Acta Medicinae Sinica) 联系电话：0773-2805467 电子邮箱：huaxia@glmc.edu.cn 地址：广西桂林市临桂区致远路1号桂林医学院明德楼316 (541199)